Malgré ce rôle clé, peu de connaissances sont disponibles sur la diversité et les fonctions microbiennes dans les eaux souterraines en France. Ces connaissances sont pourtant un prérequis essentiel pour acquérir une meilleure compréhension du fonctionnement des aquifères et de l'impact de la pollution, étape nécessaire à l'élaboration de nouveaux outils de surveillance, complémentaires de ceux déjà existants, pour améliorer la gestion des eaux souterraines. Ce projet de thèse aura pour objectifs de : i) caractériser la diversité et l'état fonctionnel des bactéries dans plusieurs contextes hydrogéochimiques, ii) évaluer les impacts de pressions anthropiques sur les cycles biogéochimiques majeurs des eaux souterraines et iii) construire une boite à outils permettant de croiser les différentes sources d'information afin de développer de nouveaux indicateurs de gestion. Pour atteindre ces objectifs, le travail de recherche s'appuiera sur des approches d'écotoxicologie microbienne (analyses microbiologiques, biologie moléculaire et expérimentation) et de géochimie en couplant des approches de terrain et de laboratoire. Financement d'un doctorant intégré dans le projet DEEPTHOUGHT (Evaluating nitrate transformation in aquifers using microbiological, molecular and isotopic tools for an enhanced management of key groundwater ecosystem services). Acquisition de données de terrain et de laboratoire en microbiologie/géochimie, analyse et interprétation des données et valorisation de la recherche.