L'Institut Pasteur conduit des recherches biomédicales de pointe et avant-gardistes depuis plus de 130 ans. Sur notre campus de 5 hectares en plein Paris (15è arrondissement), dans un environnement multiculturel et stimulant, 3000 personnes collaborent pour répondre aux ambitions de l'Institut Pasteur. Rattachée à l'unité Ecologie et Evolution de la Résistance aux Antibiotiques, la personne recrutée interviendra dans le projet ANR PARTHAGE. L'objectif de PARTHAGE est de comprendre, par la modélisation, les facteurs contribuant à la dissémination et à la transmission de souches d'entérobactéries multirésistantes dans des structures hospitalières. Le projet PARTHAGE implique des équipes de cliniciens des hôpitaux de Caen, Avicenne et Garches (APHP). Missions : Dans ce contexte, la mission principale de la personne recrutée sera de : - Réaliser des analyses génomique et métagénomique sur des échantillons cliniques afin de quantifier la contribution du microbiome digestif dans l'acquisition de souches multirésistantes. - Une mission secondaire sera l'analyse des facteurs contribuant à la transmission des plasmides et à leur stabilité. La personne recrutée sera formée à l'analyse bio-informatique des données générées.