Prendre en charge l’analyse en épidémiologie moléculaire des souches bactériennes en intégrant les architectures génomiques, les déterminants génétiques, l’origine géographique, les paramètres environnementaux et socio-économiques, et tout autre élément pertinent. La mission de 36 mois est dédiée à 100% aux actions 1.1 et 1.3 du projet RESIST-OI (AntibioRÉSISTance dans le sud-ouest de l’Océan Indien : Approche One Health pour l’étude de l’émergence, la dynamique de diffusion et des alternatives thérapeutiques). Sous la responsabilité de Guillaume MILTGEN (PUPH, UMR PIMIT/CHU de La Réunion) et Patrick MAVINGUI (DR CNRS/UMR PIMIT), vos activités seront les suivantes : Activités : - Coordination de l’arrivée des prélèvements au laboratoire coordinateur (UMR PIMIT/ Laboratoire de Microbiologie CHU Réunion). - Identification moléculaire et phylogénétique des bactéries multi-/hautement-résistantes. - Caractérisation des profils de résistance phénotypiques et du résistome - Caractérisation des déterminants génétiques et comparaison génomiques des isolats bactériens - Évaluation éco-épidémiologique, socio-économique et clinique des résistances en regard des informations collectées par questionnaires. Vous intégrerez une petite équipe dynamique de 5 chercheurs avec des interactions hebdomadaires avec l’ensemble de l’UMR PIMIT (présentations scientifiques, communications scientifiques locale ou régionale, séminaires de formation…)