Le cabinet du directeur général, composé de 30 agents, assure l'ensemble des fonctions supports de la direction : budget, ressources humaines, communication, informatique et systèmes d'information, moyens généraux, immobilier, communication. Outre ces missions, le cabinet exerce les missions d'animation du dialogue social interministériel et de coordination de dossiers et projets transverses au profit de la direction. Au sein du cabinet, la mission des affaires transverses et du dialogue social interministériel (MATDSI) assure en son sein le secrétariat des instances de dialogue social interministérielles (CCFP, CSFPE), prépare l'agenda social, coordonne les dossiers et projets transversaux pour la DGAFP et organise les comités de pilotage des DRH. Il est en lien avec l'ensemble des départements de la direction, le secrétariat général des ministères économiques et financiers, le cabinet du ministre en charge de la fonction publique et les ministères.